Если несколько лет назад был опубликован полный геном оранжевой рыбы-клоуна — оригинального Немо, то лишь недавно ученым удалось составить последовательность генома ложной рыбы-клоуна (Amphiprion ocellaris) — родственного вида, обитающего в районе Окинавы, Филиппин, Юго-Восточной Азии и северо-западной Австралии.

Ложная рыба-клоун обитает в тропических и субтропических регионах и для выживания полагается на морских анемонов из коралловых рифов. Как и в случае со многими другими рыбами коралловых рифов, ожидается, что их популяция будет сокращаться по мере уменьшения коралловых рифов из-за изменения климата.

Исследователи собрали ложных рыб-клоунов из вод вблизи Онна-сон, деревни на острове Окинава, извлекли образцы их ДНК и РНК и составили подробную карту их геномов. Они обнаружили, что ложная рыба-клоун, как и ее оранжевый родственник, принадлежит к подсемейству anemonefish, которое состоит в общей сложности из 28 видов рыб. Далее ученые сравнили геномы оранжевой и ложной рыб-клоунов, чтобы выяснить, какие гены у этих двух видов являются общими, но могут отсутствовать у других 26 видов.

Д-р Рю и его коллеги обнаружили 70 генов, которые были сохранены в геномах оранжевой и ложной рыб-клоунов, но не в геномах остальных 26 видов. Значительная часть этих генов связана с нейробиологическим функционированием, что, вероятно, влияет на поведение и экологию этих двух видов рыб-клоунов, отличая их от других видов рыб-анемонов. 

Исследование опубликовано в журнале G3 Genes | Genomes | Genetics.