Относительно быстрое появление многочисленных вариантов вируса COVID-19 озадачило исследователей, поскольку большинство коронавирусов не мутируют и не эволюционируют так быстро. Это связано с тем, что они обладают встроенным механизмом «корректуры», предотвращающим мутации, поскольку они создают копии самих себя во время роста и размножения в наших клетках.
Но ученые из Университета Южной Калифорнии выяснили, как вирус COVID-19 обходит корректор: Он захватывает ферменты в клетках человека, которые обычно защищают от вирусных инфекций, и использует эти ферменты для изменения своего генома и создания вариантов.
По словам ведущего исследователя Сяоцзяна Чена, профессора биологических наук и химии в Дорнсайфском колледже литературы, искусств и наук Университета Южной Калифорнии, полученные результаты могут оказаться жизненно важными для сдерживания пандемии, помогая предотвратить новые всплески инфекции, вызванные новыми вариантами.
Чен и команда Университета Южной Калифорнии заразили человеческие клетки коронавирусом в лаборатории, а затем изучили изменения в геноме вируса, когда он размножался, создавая свои копии, внутри клеток.
Последовательность генетического кода вируса, который состоит из ДНК, близкой родственницы РНК, использует четыре буквы для обозначения нуклеотидов компонентов: A, C, G, U. В ходе анализа Чен и его команда заметили интересную закономерность: Многие мутации, возникавшие в процессе репликации вируса, были вызваны заменой одного конкретного нуклеотида в коде на другой — буква «C» менялась на «U».
Высокая частота мутаций C-to-U навела их на группу ферментов, которые клетки часто используют для защиты от вирусов. Называемые APOBEC, эти ферменты преобразуют Cs в геноме вируса в Us с целью вызвать смертельные мутации.
Однако Чен и его команда обнаружили, что для вируса COVID-19, растущего в клетках человека, мутации C в Us не только не являются фатальными, но и приносят пользу вирусу, обеспечивая ему возможность мутировать, эволюционировать и создавать новые штаммы быстрее, чем ожидалось.